Cell Press新刊!Cell Genomics创刊号速览
亲爱的各位同仁:
我们秉承开放、合作和开拓的原则推出Cell Genomics,在该领域面临关键节点时为科学界服务。
我们对基因组学怀抱开放的心态,希望不断发现并迎接新的科学挑战,避免将基因组学局限在具体的技术或研究设计上。随着我们进入下一个科学前沿,我们需要接纳新的合作模式,开展越来越多的多学科研究。我们为这种合作和创新的全新科学方法提供一个公开讨论的平台,使新一代的基因组学研究成为可能。
我们邀请您加入我们这个开放、协作和开拓的社区,为了科学和全体社会的利益,实现基因组学的突破性转变。
我们诚挚欢迎您阅读本创刊号!
Orli G. Bahcall, PhD
Cell Genomics主编
Cell Genomics创刊号已于10月13日上线
点击文末“阅读原文”查看本期全部内容
关于封面
封面设计艺术家Alex Cagan在绘制Cell Genomics的首期封面时,试图以抽象和俏皮的方式传达本刊的三大关键支柱——“开放、合作、开拓”,其作品将基因组学领域的旋转符号与科学和开展研究的科学家形象相融合。它们通过舞蹈一样跃动的语言统一了起来,这仿佛也反映了美丽复杂的细胞机制和生命节律,以及正在进行的理解它们的科学之旅。该作品旨在体现这一持续的、充满希望的发现历程。
插图:Alex Cagan, Twitter: @ATJCagan
https://atjcagan.squarespace.com
下面请跟随小编一睹Cell Genomics创刊号都有哪些精彩的内容吧!
Editorial
Genomics for all: Open, collaborative, pioneering
我们欢迎大家打开Cell Genomics的创刊号,这是一个开放、合作、开拓的全新基因组学论坛,是基因组学领域致力于开放获取和开放科学的全新研究期刊,我们支持公开分享研究、方法和数据集。
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Q&A
Meet our Editor-in-Chief
在本篇Q&A问答中,我们的主编Orli G. Bahcall讨论了她的职业发展道路以及推出Cell Genomics的愿景。
Orli曾在伦敦帝国学院获得流行病学和数学建模博士学位、以马歇尔学者(Marshall Schola)的身份在牛津大学获得硕士学位,并在麻省理工学院获得学士学位。
Orli G. Bahcall博士拥有超过17年的编辑经验,她是基因组学战略发展的领导者。她提倡支持数据可用性和标准化、开放获取和透明审查的新政策。她为Cell Genomics带来了对科学的热爱、对合作研究的热情,以及对研究、编辑和审议过程中开放性和透明度的承诺。
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Articles
Regulation of protein abundance in genetically diverse mouse populations
Keele及其团队使用来自不同基因小鼠种群的肝脏组织,对其蛋白质丰度进行了定量分析,并报告了研究结果,这是描述蛋白质调控特征的有力资源。他们绘制了单个蛋白质及复合物的数量性状位点(QTLs)图,发现单个蛋白质的局部遗传效应和性别差异在近交系和远亲杂交系小鼠之间是一致的。
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Association of mitochondrial DNA copy number with cardiometabolic diseases
Liu及其团队针对来自TOPMed和UK Biobank的408,361名参与者,研究了线粒体DNA(mtDNA)拷贝数(CN)与心脏代谢特征的关系,这是关于这些特征的最全面的跨祖源分析。他们发现,65岁以上的参与者显示出了mtDNA CN的下降,而且在较低的mtDNA CN水平上,这种下降与肥胖、糖尿病、高血压和高脂血症等存在非年龄依赖性关联。
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Short articles
Population genomics of the critically endangered kākāpō
针对极度濒危的kākāpō(一种不会飞的鹦鹉),Dussex与团队对其现代和历史基因组进行了全基因组测序,研究长期小种群规模的遗传后果。他们发现,目前存活的kākāpō主要来自一个小岛种群,它们大多是近亲繁殖的,但与现已灭绝的大陆种群相比,其有害突变较少。该研究为濒危动物的保护策略提供了重要启示。
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Sequencing-based genome-wide association studies reporting standards
McMahon及其团队分析了基于测序(sequencing-based)的GWAS文献并报告了其结果,发现这些研究与基于基因阵列(array-based)的GWAS相比存在一些缺陷,包括缺乏标准化的语言、报告不完整,以及较少分享摘要统计等。作者针对基于测序的GWAS报告和分享提出了建设性意见,有助于提高这些数据集的FAIR性。
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Resource
Transcriptome-wide Cas13 guide RNA design for model organisms and viral RNA pathogens
为了加快使用CRISPR技术靶向RNA的进程,Guo及其团队呈现了一个整合资源,其中包括优化的RfxCas13d向导RNA(gRNAs),用于靶向六种常见的模式生物(model organisms)和四个RNA病毒家族中的信使RNAs和非编码RNAs。Guo及其团队同时提供了一个开放获取的网络平台与设计工具,可以为任一RNA靶点进行最佳的gRNA设计。
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1974年,我们出版了首本旗舰期刊《细胞》。如今,CellPress已发展为拥有50多本期刊的全科学领域国际前沿学术出版社。我们坚信,科学的力量将永远造福人类。
CellPress细胞出版社
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